ilustrasi iStock
Sebuah tim peneliti yang didanai oleh National Institutes of Health telah menunjukkan bahwa tes antigen cepat yang tersedia secara komersial dapat mendeteksi varian yang menjadi perhatian di masa lalu dan sekarang serta telah mengidentifikasi potensi mutasi yang dapat memengaruhi kinerja tes di masa depan. Ketika varian baru virus SARS-CoV-2 terus bermunculan, kekhawatiran meningkat terhadap kinerja tes antigen cepat.
Tim yang didanai oleh Rapid Acceleration of Diagnostics (RADX) NIH) Program Teknologi mengembangkan metode untuk mengevaluasi bagaimana mutasi pada SARS-CoV-2 dapat memengaruhi pengenalan antibodi yang digunakan dalam tes antigen cepat. Karena sebagian besar tes antigen cepat mendeteksi protein nukleokapsid atau protein N SARS-CoV-2, tim secara langsung mengukur bagaimana mutasi pada protein N memengaruhi kemampuan antibodi klinis untuk mengenali targetnya.
“Tes antigen cepat tetap menjadi alat mitigasi COVID-19 yang penting, dan penting untuk memastikan bahwa tes ini dapat mendeteksi virus SARS-CoV-2 seiring perkembangannya,” kata Bruce J. kata Tromberg, Ph.D., direktur. Direktur Institut Nasional Pencitraan Biomedis dan Bioteknologi (NIBIB) dan pemimpin program RADx Tech di NIH. “Mengingat siklus varian baru yang tiada akhir, data dari penelitian ini akan berguna di tahun-tahun mendatang.”
pembelajaran, Diterbitkan di SAIL, menggunakan metode yang disebut pemindaian mutasi mendalam untuk secara bersamaan mengevaluasi bagaimana substitusi asam amino tertentu pada protein N dapat memengaruhi pengikatan antibodi klinis. Para peneliti menghasilkan perpustakaan variasi protein N yang luas, termasuk sekitar 8.000 substitusi asam amino tunggal – mewakili lebih dari 99,5% dari semua kemungkinan mutasi – dan menggunakannya dalam 11 tes antigen cepat yang tersedia secara komersial. Tes antigen cepat sering kali menggunakan dua antibodi diagnostik yang berbeda untuk mendeteksi virus SARS-CoV-2.
Untuk setiap antibodi klinis yang dievaluasi, para peneliti mendokumentasikan mutasi mana pada protein N yang memengaruhi pengenalan antibodi. Dari informasi ini, mereka membuat ‘profil mutasi pelarian’ untuk setiap antibodi, yang mencantumkan mutasi spesifik pada protein N yang berdampak pada kemampuan antibodi untuk mengikat targetnya. Meskipun beberapa antibodi klinis mengenali wilayah protein N yang sama, para peneliti menemukan bahwa setiap antibodi memiliki profil mutasi yang unik. Seiring dengan terus berkembangnya virus SARS-CoV-2, data ini dapat digunakan untuk mengkarakterisasi antibodi spesifik yang kinerja diagnostiknya mungkin perlu dievaluasi ulang.
Penulis studi pertama, Philip Frank, Ph.D. mengatakan, “Berdasarkan temuan kami, tidak ada varian utama SARS-CoV-2 yang menjadi perhatian di masa lalu dan saat ini yang memiliki mutasi protein N yang akan memengaruhi deteksi oleh antibodi yang digunakan dalam tes antigen cepat saat ini.” , asisten profesor di departemen biokimia di Universitas Emory di Atlanta. “Selain itu, data ini dapat menginformasikan desain uji coba dengan mengidentifikasi antibodi diagnostik mana yang harus ditambahkan untuk mengidentifikasi jumlah maksimum variasi protein N potensial.”
Penulis studi senior Eric Ortlund, Ph.D. mengatakan, “Identifikasi individu yang terinfeksi secara akurat dan efisien tetap menjadi strategi penting untuk mitigasi COVID-19, dan penelitian kami memberikan informasi tentang mutasi SARS-CoV-2 di masa depan yang mungkin lebih mudah dideteksi.” Profesor di Departemen Biokimia di Universitas Emory. “Hasil yang diuraikan di sini memungkinkan kita beradaptasi dengan cepat terhadap virus ketika varian baru terus bermunculan, yang mewakili implikasi klinis dan kesehatan masyarakat.”
Meskipun banyak varian yang menjadi perhatian memiliki banyak mutasi pada protein N, penulis penelitian mencatat bahwa metodologi mereka tidak mengevaluasi bagaimana banyak mutasi dapat memengaruhi pengenalan antibodi klinis, yang merupakan keterbatasan penelitian ini.
Proyek ini sebagian didukung oleh dana dari American Rescue Plan Act tahun 2021 yang dikelola oleh NIBIB dengan nomor penghargaan U54EB015408 dan U54EB027690. Karya ini juga didukung dengan nomor penghargaan 75N92019P00328. Dukungan ini merupakan bagian dari inisiatif RADx yang diluncurkan untuk mempercepat inovasi dalam pengembangan, komersialisasi, dan penerapan teknologi pengujian COVID-19.
Para peneliti juga didukung oleh National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases dengan nomor penghargaan R01DK115213; Institut Alergi dan Penyakit Menular Nasional dengan nomor penghargaan K99AI153736; dan Career Development Award 848388 di bawah American Heart Association.
,
Tentang Akselerasi Diagnostik Cepat (RADX)) Inisiatif: Inisiatif RADx diluncurkan pada tanggal 29 April 2020 untuk mempercepat inovasi dalam pengembangan, komersialisasi, dan penerapan teknologi untuk pengujian COVID-19. Inisiatif ini memiliki empat program: RADx Tech, RADx Advanced Technology Platform, RADx Underserved Populations, dan RADx Radical. Ini memanfaatkan Jaringan Penelitian Teknologi Point-of-Care NIH yang ada. Inisiatif RADx bermitra dengan lembaga-lembaga federal, termasuk Kantor Asisten Menteri Kesehatan, Departemen Pertahanan, Otoritas Penelitian dan Pengembangan Lanjutan Biomedis, dan Badan Pengawas Obat dan Makanan AS. Pelajari lebih lanjut tentang inisiatif RADx dan program-programnya: https://www.nih.gov/radx,
Tentang Institut Nasional Pencitraan Biomedis dan Bioteknologi (NIBIB): Misi NIBIB adalah meningkatkan kesehatan dengan memimpin pengembangan dan mempercepat penerapan teknologi biomedis. Institut ini berkomitmen untuk mengintegrasikan ilmu fisika dan teknik dengan ilmu hayati untuk memajukan penelitian dasar dan perawatan medis. NIBIB mendukung penelitian dan pengembangan teknologi baru di laboratorium internalnya dan melalui hibah, kolaborasi, dan pelatihan. Informasi lebih lanjut tersedia di situs web NIBIB:
Tentang Institut Kesehatan Nasional (NIH): NIH, badan penelitian medis nasional, terdiri dari 27 lembaga dan pusat dan merupakan komponen dari Departemen Kesehatan dan Layanan Kemanusiaan AS. NIH adalah lembaga federal utama yang melakukan dan mendukung penelitian medis dasar, klinis, dan translasi, serta menyelidiki penyebab, pengobatan, dan penyembuhan penyakit umum dan langka. Untuk informasi lebih lanjut tentang NIH dan programnya, kunjungi https://www.nih.gov/,
NIH…Menerjemahkan Penemuan ke Kesehatan
,
Dilansir dari dan telah tayang di: https://agenbrilink.net/berita/tim-yang-didanai-nih-mengembangkan-metode-untuk-mengidentifikasi-mutasi-sars-cov-2-di-masa-depan-yang-dapat-memengaruhi-kinerja-tes-antigen-cepat/20223/