Dari seluruh protein virus SARS-CoV-2 (patogen penyebab COVID-19), protein lonjakan lah yang paling mendapat perhatian. Perlu diperhatikan – protein lonjakan sangat penting untuk menempel pada sel dan menginfeksi inang, dan tiga vaksin resmi FDA untuk melawan COVID-19 berfokus pada protein lonjakan. Meskipun invasi awal virus ke dalam inang tentunya merupakan langkah penting dalam siklus hidup virus, begitu berada di dalam sel, virus harus bereplikasi agar dapat bertahan hidup. Dan di sinilah protein nukleokapsid, atau protein N, berperan.
Protein N adalah protein paling melimpah dari virus SARS-CoV-2. Tugasnya adalah mengemas genom virus ke dalam struktur yang disebut partikel ribonukleoprotein, yang kemudian dimasukkan ke dalam virion baru yang keluar dari sel yang terinfeksi untuk menimbulkan kerusakan pada sel di sekitarnya. Karena perannya yang penting dalam perakitan dan replikasi virus, protein N merupakan target imunologi yang menjanjikan untuk strategi anti-COVID-19.
Ilustrasi potongan partikel virus corona. Penelitian menunjukkan bahwa setiap virus mengandung beberapa partikel ribonukleoprotein. Kredit: Wikimedia Commons; Lihat informasi lisensi di bawah.
“Mengingat pertumbuhan varian SARS-CoV-2 yang tak terhindarkan, strategi multi-cabang yang dapat mencegah penyakit atau membatasi keparahan COVID-19 sangatlah penting,” kata Peter Shook, Ph.D., peneliti NIBIB Said di bagian tersebut. Dinamika kumpulan makromolekul. “Protein N merupakan faktor penting dalam perakitan virus, namun cara pasti protein ini mengemas genom SARS-CoV-2 masih belum diketahui. Jika kami dapat lebih memahami proses ini, kami dapat mengidentifikasi target yang akan menghambat replikasi virus, sehingga memberikan pendekatan tambahan terhadap vaksin atau pengobatan COVID-19,” katanya.
Penelitian Shook, baru-baru ini diterbitkan ilmu pengetahuan(1), penelitian ini meneliti bagaimana protein N berinteraksi dengan oligonukleotida – bagian kecil DNA dan RNA – untuk mempelajari bagaimana genom virus dikemas. Dengan menggunakan metode biofisik, Shook dan rekannya menemukan bahwa ketika protein N berinteraksi dengan nukleotida yang cukup panjang, ia akan mengambil bentuk yang mendorong interaksi dengan protein lain. Lebih jauh lagi, ketika protein N berasosiasi dengan banyak salinan dirinya sendiri dan segmen oligonukleotida yang panjang, ia dapat berkondensasi menjadi tetesan dengan konsentrasi tinggi yang diperkirakan pada akhirnya memungkinkan pembentukan partikel ribonukleoprotein. Menargetkan interaksi antara protein N dan mitra pengikatnya bisa menjadi cara yang tepat untuk menghambat replikasi virus SARS-CoV-2, kata Shook.
“Penelitian kami hanyalah sebagian kecil dari teka-teki yang ditimbulkan oleh siklus hidup virus SARS-CoV-2,” kata Shook. “Kami sekarang memiliki beberapa petunjuk tambahan tentang bagaimana protein N memulai perakitan partikel ribonukleoprotein, yang merupakan bagian penting – dan berpotensi dapat dibius – dalam replikasi virus.”
Pekerjaan ini didukung oleh Program Penelitian Intramural dari Institut Pencitraan Biomedis Nasional
dan Institut Nasional Gangguan Neurologis dan Stroke (NINDS) dalam Bioteknologi (NIBIB), Institut Jantung, Paru-Paru, dan Darah Nasional (NHLBI), Institut Kanker Nasional (NCI), dan Institut Kesehatan Nasional.
Ikhtisar Ilmiah ini menjelaskan penemuan penelitian dasar. Penelitian dasar meningkatkan pemahaman kita tentang perilaku manusia dan biologi, yang merupakan dasar untuk memajukan metode pencegahan, diagnosis, dan pengobatan penyakit yang baru dan lebih baik. Sains adalah proses yang tidak dapat diprediksi dan bertahap – setiap kemajuan penelitian dibangun berdasarkan penemuan-penemuan masa lalu, seringkali dengan cara yang tidak terduga. Sebagian besar kemajuan klinis tidak akan mungkin terjadi tanpa pengetahuan tentang penelitian dasar yang mendasar.
Dilansir dari dan telah tayang di: https://agenbrilink.net/berita/studi-biofisik-menyoroti-proses-replikasi-sars-cov-2-yang-berpotensi-dapat-diobat/21656/